این مرکز شامل واحدهای زیر است:
1-    واحد انتشارات
2-    واحد آموزش
3-    واحد تحقیقات
4-    واحد روابط عمومی
5-    واحد مالی
تبصره: واحدهای مختلف بر اساس نیاز روز و توانمندیهای اعضای مرکز قابلیت تغییر و اضافه نمودن را دارد که با تصویب شورای مرکزی و تایید رئیس مرکز این فرایند انجام خواهد شد.
 
تشکیلات و شرح وظایف واحدها به صورت زیر میباشد:
واحد انتشارات:
مسئول واحد: ..................
این واحد خود درای سه زیر مجموعه است: سایت اینترنت، کتابخانه و منابع، و چاپ کتاب و مقاله.
سایت اینترنتی شامل اطلاعات مورد نیاز محققین است و باید اطلاعات آن به روز باشد و هر 2 هفته به روز گردد. واحد روابط عمومی موظف است که اطلاعات همه واحدها را در اختیار واحد انتشارات قرار دهند تا در سایت قرار گیرد. همچنین این واحد باید امکانات اینترنت برای جستجوی مقالات لازم را در اختیار محققین قرار دهد و همچنین نتایج تحقیقات مرکز را در سایت اینترنتی منتشر کنند.
کتابخانه شامل کتابها و ژورنالهای کاغذی و یا الکترونیکی مورد نیاز محققین میباشد. منابع تا حد امکان باید جدید باشند. واحدهای مختلف کتابهای مورد نیاز خود را به واحد انتشارات اعلام میکنند و این واحد این کتابها را تهیه مینماید.
همکاری در زمینه چاپ کتابها، تهیه و نوشتن مقالات نیز از وظایف این واحد است که پیگیری های لازم را برای رفع اشکال مقالات انجام دهد تا به مرحله چاپ برسد. همچنین کتابها و جزوات لازم در جهت نیاز اعضای مرکز نیز توسط این واحد تهیه و منتشر میشود.
 
واحد آموزش
مسئول واحد آموزش:..................................
وظیفه این واحد اطلاع رسانی در مورد سمینارها، کارگاهها و فرصتهای مطالعاتی مختلف داخلی و خارجی میباشد. همچنین این واحد میتواند در جهت نیازهای محققین کارگاههای لازم را برگزار نماید و اساتید مورد نیاز را با همکاری روابط عمومی دعوت نماید. لازم است این واحد پویا باشد و با انجام نیازسنجی از اعضای مرکز، آموزشهای لازم برای آنها را برنامه ریزی کند. در صورت برگزاری کارگاه باید اطلاع رسانی از 2 هفته قبل در سایت و همچنین با پوستر انجام گیرد. هماهنگی جهت شرکت در سمینارها و کنگره ها توسط این واحد و با همکاری واحد انتشارات انجام گرفته و نتایج تحقیقات به صورت پوستر یا سخنرانی تهیه میشوند.
 
روابط عمومی:
مسئول واحد روابط عمومی: جمیله محتشم
            این واحد وظیفه دفتر گردانی، بایگانی و هماهنگی و ارتباط بین واحدها و اعضا را بعهده دارد. تهیه و بروز رسانی CV اعضای مرکز بعهده این واحد است. همه مدارک و مستندات علمی اعضا باید اسکن شده و یک نمونه کاغذی از آنها را بایگانی کند. هماهنگی جلسات و اطلاع رسانی واحدهای مختلف به عهده این واحد است.
 
واحد تحقیقات:
            وظیفه این واحد که شامل زیرگروههای بهداشت، بالینی، پایه، هوشمند و مشاوره پژوهشی است طراحی و هدایت تحقیقات در زمینه های مورد نیاز جامعه و نیز جامعه چشم پزشکان خواهد بود. این واحد وظیفه دارد طرحهای پژوهشی را طوری طراحی نماید که کیفیت بالا داشته و قابلیت چاپ بیشتر از یک مقاله از هر طرح بوجود آید. اعضای همکار از دیگر قسمتهای دانشگاه از قبیل سیستم بهداشتی، گروههای پایه و ... نیز میتوانند در این زیرگروهها عضو شوند.
زیر گروه بهداشتی لازم است تحقیقات خود را روی مسایل بهداشتی جامعه متمرکز کند و در جهت شناسایی و رفع مشکلات با همکاری سیستم بهداشتی، سازمان بهزیستی و ... پژوهشهایی را طراحی و هدایت کند.
             زیر گروه بالینی نیز طراحی و هدایت پروژه های بالینی را انجام خواهد داد. این زیر واحد میتواند فعالیتهای خود را فوق تخصصی نماید و در زمینه های رتین، گلوکوم، کاتاراکت، استرابیسم و .... فعالیت نماید.
            زیر گروه پایه لازم است با گروههای میکروبیولوژی، سلولی مولکولی، پاتولوژی، ایمونولوژی، بافت شناسی، کامپیوتر و دیگر گروههایی که میتوانند در پروژه های تحقیقاتی فعالیت کنند و باعث ارتقای سطح کیفی پژوهشها شوند همکاری کند و همکاری این گروهها را جلب نماید. این زیر گروه باید فعالیتهای علمی سلولهای بنیادی را جزو اولویتهای خود قرار دهد.
            زیر گروه هوشمند در زمینه طراحی ابزارهای الکترونیکی مرتبط با چشم مصنوعی و سایر مصنوعات مورد نیاز چشم پزشکی فعالیت خواهد کرد و لازم است که همکاری گروههای دانشگاهی دیگر که میتوانند با این مقوله مرتبط باشند را جلب نماید و پژوهشهای مشترکی را انجام دهد.
            زیر گروه مشاوره پژوهشی موظف است مشاوره های پژوهشی و آماری را به محققان در تمام زمینه ها ارایه دهد. همچنین فعالیتهای این زیر گروه باید آینده نگر بوده و تولید علم و چاپ مقالات را از همان ابتدای مشاوره و طراحی تحقیق مدنظر قرار دهد بصورتی که بر تمام مراحل پژوهش نظارت کرده و در زمینه مقاله نویسی و برگزاری کارگاهها همکاری های لازم را داشته باشد. طراحی، تحلیل و نظارت بر پژوهشهای انجام شده نیز توسط این واحد انجام خواهد گرفت.
تبصره: لازم به ذکر است که هر واحد دارای یک مسئول است که عضو شورای پژوهشی هستند و توسط رئیس مرکز به مدت دو سال انتخاب میشوند. مسئول هر واحد میتواند اعضایی را برای واحد خود انتخاب کند.
تبصره: هر واحد و زیر گروه باید اولویتهای تحقیقاتی خود را هر ساله ارایه دهند و عناوین پیشنهادی خود برای پژوهش را منتشر کنند تا محققان و دانشجویان دسترسی مناسبی به این عناوین داشته باشند.
 
واحد مالی و حسابداری:
این واحد هزینه های مرکز را کنترل کرده و در زمینه تخصیص بودجه به فعالیتها و طرحهای تحقیقاتی فعالیت میکند. کلیه هزینهای مرکز توسط این واحد بررسی و تامین میگردد.